현대 사회에서 NGO부문의 사회·경제·정치적 기능은 크게 증가하고 있으며 이러한 변화는 정부와의 관계에 있어 새로운 이론적 발전을 요구하고 있다. 본 연구에서는 정부와 NGO간의 기본적인 관계는 양자간의 자원 교환관계에서 발생한다고 가정하고 논의의 초점을 조직(제도)간의 상호작용에 두었다. 정부와 NGO가 각각 보유하고 있는 자원은 서로의 제도 및 행태에 큰 영향을 미칠 수 있기 때문이다. 이러한 이론적 배경아래 본 연구에서는 이러한 영향력의 상대적 비중 및 상황적인 변수에 따라 정부-NGO관계를 상호의존적 관계, 정부주도 또는 NGO주도의 일방적인 의존관계, 상호 독립적인 관계로 범주화하여 유형별 특성과 사례를 분석하였다. NGO가 advocacy 및 서비스분야 등의 다양한 영역에서 활동을 하고 있기 때문에 정부-NGO의 관계를 평면적이고 정부에 의한 일방적인 것으로 보는 것은 위험하다. 오히려 그 관계는 다원적이며 다차원적이기 때문에 서로의 역할을 인정하고 비교우위에 근거하여 상호작용함에 따라 발전적인 관계로 변화시켜야 할 것이다. 그리고 이러한 변화는 정부가 제도적 다원주의를 인정하고, NGO가 내·외부적인 노력을 통하여 핵심역량을 확보했을 때 가장 큰 효과를 발휘할 수 있을 것이다.