본 연구는 세계적으로 보기 드문 유사성을 지닌 한일 국가관료제간에 기능의 내용과 조직 규모 상 차이점은 없는지, 있다면 어떤 차이점이 있는지, 나아가 이러한 차이점은 미래의 한국정부 기능에 어떤 함의를 줄 수 있는지에 관해 문제제기를 하고, 이들 질문에 대한 해답을 탐색하는데 그 목적을 둔다. 이를 위해 한국의 47개 부처 중 국제적으로 보편적인 기능들을 가장 높은 비율로 수행하고 있는 것으로 판명된 법무부, 환경부(이상 규제정책 기능), 산업통상부, 교육부(이상 분배정책 기능), 보건복지부, 고용노동부(이상 재분배정책기능), 외교부(외교정책 기능)의 대기능들과 이에 상응하는 일본 성청의 대기능들을 비교 분석하였다. 다시 말해 미시적 차원에서 양국 중앙행정기관의 대기능간 내용 및 조직규모상의 유사점과 차이점을 확인하였고, 거시적 시각에서 기관유형별 양국 간 조직규모 상의 차이를 분석하였다. 그 결과 한국의 규제기관은 일본의 상대기관에 비해 대체적으로 약 2배의 인력규모를 지니고 있었으며, 분배기관은 1.5배, 그리고 재분배기관과 외교기관은 각각 80%와 40% 수준의 인력을 지니고 있었다. 이러한 연구결과는 앞으로 한국 정부가 사회복지·보건서비스, 노후생활보장, 고용안정에 힘을 쏟는 선진국 형 복지국가를 지향하고, 불확실한 국제정세에 대비하기 위한 외교역량을 한층 증진시킬 필요가 있음을 시사하고 있다. 아울러, 일본 중앙행정기관은 정책영역을 불문하고 잘 발달된 지리적 구조, 즉 각지역에 ‘지방지분부국’을 설치하고 중앙이 직접 업무를 수행하고 있음을 확인하였다. 본 연구는 기존 한일 중앙정부기구의 비교연구가 간과한 실, 국 차원의 대기능간 내용 및 조직규모 상의 미시적 비교분석을 하였다는 점에서 학술적 의미를 지닌다.